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基于网络药理学和蛋白质组学筛选沙棘总黄酮抑制HAPC小鼠红系细胞过度生成的作用靶点

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  • 用途: 硕士毕业论文 Master Thesis
  • 作者:上海论文网
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  • 日期:2023-02-23
  • 来源:上海论文网

医学论文哪里有?笔者经过研究,得出结论:沙棘总黄酮可显著抑制HAPC小鼠红系细胞过度生成,并且可改善组织、细胞病理损伤。

第一章 材料与方法

1.2  试验方法

1.2.1  蛋白质提取和肽段酶解

首先,对各组小鼠的肾脏样品采用SDT裂解液提取蛋白质。而后,应用BCA法进行蛋白质的定量分析。对每个样品取适量蛋白质,采用FASP法将其酶解为肽段。最终,采用C18 SPE柱对肽段进行脱盐,待肽段冻干之后后,加入40μL 0.1%甲酸溶液进行复溶,后进行OD280肽段定量。

1.2.2  LC-MS/MS数据采集

先对每份样品应用纳升级别的HPLC液相系统进行分离。其中缓冲液A液为0.1%甲酸水溶液,缓冲液B液为0.1%甲酸乙腈水溶液(乙腈的浓度为84%)。色谱柱以95%的A液平衡,样品经由自动进样器上样至上样柱,而后利用分析柱分离,设定流速为300 nL/min。

每份样品经过色谱法分离后,使用timsTOF Pro质谱仪对其进行质谱分析。检测方式为正离子,离子源电压设置为1.5 kV,MS及MS/MS均用TOF进行检测和分析。质谱扫描范围设置为100-1700m/z。数据采集模式采用平行累积串行碎裂(PASEF)模式,一张一级质谱采集后进行10次PASEF模式采集母离子,一个循环窗口时间为1.17秒。电荷数在0-5范围内的二级谱图,串联质谱扫描的动态排除时间设置为24秒避免母离子的重复扫描。

第二章 实验结果

2.1  蛋白定量及鉴定结果

在本章的定量蛋白质组学研究中,通过对各组样本进行质谱分析,总共获得2014901张谱图。其中,得到可利用的有效谱图数为505849张。而后,应用MaxQuant软件进行鉴定,共获得肽段46703条,其中特异性肽段共45262条。通过肽段的一级和二级碎片进行鉴定共得蛋白5837,其中5822个蛋白可定量分析,详见图7。

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2.2  差异蛋白谱的获取

为了探索沙棘总黄酮抑制HAPC红系细胞过度增殖的作用靶点及相关机制。将HAPC模型组与平原组比较,将四个药物组与HAPC模型组相比较,设定评价标准:表达倍数≥1.20或≤1.83.P<0.05,获得各组显著差异表达蛋白谱。将各组差异表达蛋白谱进行比较,所得到的重合部分即为沙棘总黄酮抑制HAPC小鼠红系细胞过度生成的差异蛋白,详见表8。

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第三章 讨论

铁代谢:

铁是体内含量最丰富的微量元素。机体内铁的来源包括从食物中获取和衰老红细胞的破坏。食物中的铁在肠道经肠上皮细胞刷状缘细胞色素酶B还原成Fe2+,后被膜上的二价金属转运蛋白1转入到肠上皮细胞内[45]。铜蓝蛋白(Ceruloplasmin,CP)是机体内重要的亚铁氧化酶,可将细胞内二价铁氧化为为三价铁,之后进入血液循环。转铁蛋白(Transferrin,Tf)是运载铁离子的载体,在血中与游离铁结合,经血循环将其转运到机体各个组织细胞[46]。之后,Tf通过与细胞表面转铁蛋白受体(Transferrin Receptor,TfR )结合,将所携带的铁转运至细胞内,以满足细胞对铁的需求[47]。其中,TfR c是TfR的组成部分。铁离子是合成血红蛋白的重要原料。在机体内,亚铁离子通过与原卟啉结合成血红素,而后与珠蛋白结合生成血红蛋白。在低氧条件下,机体为改善体内的缺氧情况,代偿性促进红细胞过度生成,这造成了机体对铁离子的需求加大。研究发现,在高原低氧暴露时,机体会通过促进Tf、TfR 、CP这些与铁代谢相关蛋白的高表达,以保证机体对铁的需求。研究表明,HIF-2α在高原低氧暴露时表达增高,HIF-2α可调节Tf、TfR、CP等与铁代谢相关蛋白的表达,以保证机体因血红蛋白过量生成所引起的对铁的需求[48]。

第四章 结论

1、沙棘总黄酮通过PI3K-AKT signaling pathway、HIF-1 signaling pathway、VEGF signaling pathway这三条通路发挥防治HAPC的作用。

2、沙棘总黄酮可显著抑制HAPC小鼠红系细胞过度生成,并且可改善组织、细胞病理损伤。

3、共获得五个沙棘总黄酮抑制HAPC小鼠红系细胞过度生成的靶蛋白。分别为:CAT、STAT3、CP、HSCB、UQCRB。

参考文献(略)

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